镜鲤酸性磷酸酶的QTL分析

›› 2012, Vol. 25 ›› Issue (3): 15-19.

镜鲤酸性磷酸酶的QTL分析

于彬彬,贾志武,张晓峰,郑先虎,郝卓然,于倩,孙效文

大连海洋大学生命科学与技术学院,辽宁大连116023 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070%大连海洋大学生命科学与技术学院,辽宁大连,116023%大连海洋大学生命科学与技术学院,辽宁大连116023 上海海洋大学水产与生命学院,上海201306

收稿日期:2012-03-15 出版日期:2012-03-15 发布日期:2012-03-15
通讯作者: 于彬彬

Quantitative Trait Loci Analysis for Acid Phosphatase in Mirror Carp

Received:2012-03-15 Online:2012-03-15 Published:2012-03-15

摘要/Abstract

摘要： 利用992个微卫星标记检测了德国镜鲤（Cyprinus carpio）F1代190个个体基因组DNA进行基因型检测,共组成51个连锁群,覆盖基因组总长度为5138.2cM,标记间平均距离为5.19cM;利用软件MapQTL 6.0采用区间作图法对酸性磷酸酶性状进行数量性状基因座（QTL）定位分析。研究结果共检测到9个与酸性磷酸酶有关的QTLs,分布于8个连锁群。其中LG24连锁群LOD值最大（5.37）,位于LG24连锁群,最大的可解释表型变异为13.8%。通过BLAST与斑马鱼进行序列比对,找到了与斑马鱼富含亮氨酸重复蛋白、横跨膜蛋白50a、ADP核糖化因子和细胞因子受体家族b8同源的分子标记。本研究结果对鲤鱼分子标记辅助育种和疾病调控具有重要应用价值。

关键词: 镜鲤, 遗传图谱, QTL, 酸性磷酸酶

Abstract: In this study,992 microsatellite markers were selected to analyze the genomic DNA of 190 individuals derived from the sibling group of F1 hybrids mirror carp(Cyprinus carpio L.) The map was found to span 5138.2 cM over 51 linkage groups,with an average spacing of 5.19 cM.Then quantitative trait loci(QTLs) associated with Acid phosphatase(ACP) were identified by the interval mapping of the software MapQTL 6.0.Nine QTLs were identified for ACP on eight linkage groups.Among the nine QTLs controlling ACP in mirror carp,the maximum LOD score was found to be 5.37(LG24) in which 13.8% of the phenotypic variations were explained.By BLAST with the zebrafish for sequence alignment,molecular markers were found homologous with leucine-rich repeat-containing protein,transmembrane protein 50A,ADP-ribosylation factor and cytokine receptor family member b8 in zebrafish.The findings could be well used for molecular marker assisted selection and for disease control in mirror carp.

Key words: mirror carp(Cyprinus carpio L.), genetic linkage map, QTL, Acid phosphatase(ACP)

中图分类号:

Q343.15

于彬彬;贾志武;张晓峰;郑先虎;郝卓然;于倩;孙效文. 镜鲤酸性磷酸酶的QTL分析[J]. , 2012, 25(3): 15-19.

[1]	吴景，郑先虎，匡友谊，吕伟华，曹顶臣，冬方，何立川，孙效文. 镜鲤△6脂肪酸脱氢酶CDNA的克隆与表达[J]. 水产学杂志, 2015, 28(1): 11-17.
[2]	吴景，郑先虎，匡友谊，吕伟华，曹顶臣，孙效文. 镜鲤肌肉品质性状的微卫星标记分析[J]. 水产学杂志, 2013, 26(6): 13-18.
[3]	赵吉伟;李小龙. 野生及养殖茴鱼体内ACP、AKP和CAT活力的比较研究[J]. , 2011, 24(4): 12-15,3.
[4]	李池陶;徐伟;贾智英;石连玉. 防治松浦镜鲤鱼卵水霉病药物的筛选[J]. , 2011, 24(4): 37-39,4.
[5]	鲁翠云;金万昆;李超;孙效文;杨建新. 微卫星分子标记指导镜鲤群体选育[J]. , 2011, 24(3): 29-34,4.
[6]	闫学春;梁利群;葛彦龙. 两种鲤鲫杂交回交子代染色体核型分析及比较[J]. , 2011, 24(2): 4-8.
[7]	金舒博;张晓峰;贾智英;郑先虎;孙效文. 一个镜鲤家系的遗传多样性及经济性状的遗传连锁分析[J]. , 2011, 24(1): 14-18,3.
[8]	畅雅萍;白东伟;徐奇友;张勇. 镜鲤(Cyprinus carpio specularis)肌肉营养成分分析及价值评定[J]. , 2010, 23(2): 37-41.
[9]	李池陶;张玉勇;贾智英;胡雪松;石连玉. 松浦镜鲤与德国镜鲤选育系(F4)的可量性状、鳞片数比较[J]. , 2009, 22(2): 53-55,6.
[10]	赵海燕;李池陶;石连玉;贾智英;胡雪松. 德国镜鲤选育系F4天津群体中不同体型的遗传结构分析[J]. , 2009, 22(1): 19-23.
[11]	胡雪松;李池陶;马波;石连玉. 红镜鲤6个微卫星座位的遗传多样性初探[J]. , 2006, 19(2): 37-41.
[12]	马波;金万昆. 散鳞镜鲤、团头鲂及其杂交F1肌肉营养成分的比较[J]. , 2004, 17(2): 76-78.
[13]	卢彤岩;刘洪柏;李池陶;刘明华. 两种鲤鱼对侵袭性病原体及嗜水气单胞菌抗病力的比较[J]. , 2000, 13(1): 53-56.